timsTOF Pro 2

TimsTOF Pro 2, được hỗ trợ bởi công nghệ phân mảnh nối tiếp tích lũy song song mới nhất (PASEF ®), mở đường cho các ứng dụng 4D-Multiomics. Với độ bền đã được chứng minh, độ nhạy cao và thu nhận MS/MS nhanh chóng, timsTOF Pro 2 là nền tảng được lựa chọn cho 4D-Proteomics, 4D-Metabolomics và 4D-Lipidomics.
Danh mục: Từ khóa: , Brand:

Tiêu chuẩn mới cho tốc độ cao, độ nhạy cao 4D-Multiomics

Sắc ký lỏng (LC) kết hợp với khối phổ (MS) đã trở thành tiêu chuẩn vàng trong các lĩnh vực omics khác nhau. Tuy nhiên, phạm vi bao phủ của proteome hoặc chất chuyển hóa trong các mẫu sinh học phức tạp vẫn còn nhiều thách thức do tốc độ, độ nhạy và độ phân giải của máy quang phổ khối hiện tại bị hạn chế.

Việc thêm phép đo phổ di động ion bị bẫy (TIMS) vào phương trình sẽ mở ra phương pháp thu nhận phân mảnh nối tiếp tích lũy song song (PASEF ® ) để mang lại tốc độ và độ nhạy MS/MS cực cao, yêu cầu lượng mẫu tối thiểu.

Phân tích kích hoạt Dual-TIMS và CCS

TIMS trước hết là một kỹ thuật tách trong pha khí. Điều này giải quyết độ phức tạp của mẫu thông qua một chiều phân tách bổ sung bên cạnh sắc ký lỏng hiệu năng cao (HPLC) và phép đo khối phổ, tăng công suất cực đại và độ tin cậy trong đặc tính của hợp chất.

Quan trọng không kém, thiết bị TIMS cũng tích lũy và tập trung các ion có  m/z và tính di động nhất định, cho phép tăng độ nhạy và tốc độ độc đáo.

Có thể đạt được chu kỳ làm việc gần 100% nhờ công nghệ TIMS kép tạo điều kiện tích tụ ở phần phía trước, trong khi các ion ở phần phía sau được giải phóng tuần tự tùy thuộc vào tính di động của chúng. Quá trình phân mảnh nối tiếp tích lũy song song này (PASEF ®) cho phép phân tích mặt cắt va chạm (CCS).

Phân tích hỗ trợ CCS mở ra nhiều khả năng phân tích hơn nữa, từ nhận dạng hợp chất chắc chắn hơn đến so khớp thư viện đáng tin cậy và tỷ lệ phát hiện sai (FDR) thấp hơn trong các bộ dữ liệu lớn.

PASEF®

TimsTOF Pro 2 đi kèm với bộ phân tích TIMS kép sáng tạo của chúng tôi, cung cấp khả năng ion cao hơn gấp ba lần. Quang học ion đơn giản hóa tối đa hóa khả năng truyền ion và độ nhạy để thiết lập một tiêu chuẩn mới trong 4D-Multiomics. PASEF ® là công nghệ MS/MS được thiết kế lại để đáp ứng các yêu cầu về tốc độ của các ứng dụng omics. Các ion được phân tách bằng phép đo phổ di động ion bị bẫy, rửa giải (~ 100 mili giây) và được phát hiện trong thời gian bay tứ cực (QTOF), tạo bản đồ nhiệt TIMS MS. PASEF ® sau đó sử dụng quá trình phân tách TIMS tương tự để phân mảnh các ion theo thứ tự. Bộ tứ cực cô lập một loại ion nhất định trong quá trình rửa giải MS/MS và ngay lập tức chuyển sang tiền chất tiếp theo. Phổ cha mẹ và mảnh được căn chỉnh bởi các giá trị di động. TimsTOF Pro 2 có thể đạt được tốc độ giải trình tự > 120 Hz trong chế độ

prm-PASEF ® hưởng lợi từ TIMS như chiều phân tách thứ 4 cho tính chọn lọc chưa từng có, tập trung thời gian của các ion trong hộp TIMS để tăng độ nhạy và tốc độ cao do PASEF ® hỗ trợ để tăng số lượng mục tiêu tiền thân. Trong một lần thu thập, hàng trăm tiền chất có thể được nhắm mục tiêu mà không ảnh hưởng đến tính chọn lọc độc đáo và độ nhạy cao của thiết bị timsTOF Pro 2.

PASEF® . Hơn nữa, chất lượng phổ MS/MS của các chất phân tích có hàm lượng phong phú thấp có thể được làm giàu bằng cách chọn chúng nhiều lần.

 

Tốc độ
Công nghệ PASEF® đạt được tốc độ sắp xếp thứ tự >120 Hz mà không ảnh hưởng đến độ phân giải.
Chiều sâu
Kích thước di động ion bổ sung làm tăng tính đầy đủ của dữ liệu.
Mạnh mẽ
Thiết kế thiết bị độc đáo cho phép hiệu suất mạnh mẽ và hoạt động thường xuyên trên hàng ngàn mẫu mà không cần làm sạch.

dia-PASEF ® thêm sự tự tin cho việc phát hiện

Thu thập dữ liệu độc lập (đường kính)-PASEF ® vừa nhạy cảm vừa chọn lọc hơn so với các phương pháp tiếp cận DIA truyền thống vì nó áp dụng nguyên tắc PASEF ® để kết hợp các ưu điểm của DIA với hiệu quả ion vốn có của PASEF ® . Trong toàn bộ quá trình chạy sắc ký lỏng khối phổ (LC-MS)/MS dia-PASEF ® , một khối dữ liệu hoàn hảo được tạo ra có chứa m/z, độ linh động của ion (CCS), thời gian lưu và cường độ. Tách TIMS làm tăng tính chọn lọc, loại trừ các tiền chất tích điện đơn lẻ khỏi sự phân mảnh và làm sạch mẫu bằng cách tập trung tín hiệu khỏi nhiễu. Sử dụng mối tương quan giữa trọng lượng phân tử và thông tin được mã hóa CCS từ phễu TIMS kép, dia-PASEF ® cho phép nhận dạng với độ tin cậy cao.

Tối đa hóa phạm vi bao phủ chuỗi peptide và protein 

Cấu hình hướng dẫn ion vòng xếp chồng lên nhau bằng thép không gỉ (SRIG) mạnh mẽ và các phương pháp dia-PASEF ® tiêu chuẩn được tối ưu hóa trong timsTOF Pro 2 cung cấp độ bao phủ proteome sâu chưa từng có trong proteomics một lần bắn. Gần 9000 nhóm protein đã được xác định từ 200 ng K562 lysate ở độ dốc 35 phút (~30 mẫu mỗi ngày) bằng cách sử dụng cột PepSep 25 cm với nanoElute trên timsTOF Pro 2 và thư viện quang phổ hỗ trợ TIMScore™.

TimsTOF Pro 2 cung cấp phạm vi phủ sóng chuyên sâu về hệ protein cho các thí nghiệm định lượng hệ protein của dòng tế bào hàng ngày trực tiếp bằng cách tìm kiếm và khớp cơ sở dữ liệu giữa các lần chạy mà không cần thư viện quang phổ. Các chiến lược tìm kiếm cơ sở dữ liệu khác nhau dẫn đến kết quả rất giống nhau. Bruker ProteoScape, cho phép nhận dạng protein theo thời gian thực và MaxQuant dẫn đến số ID tương tự ở cả cấp độ protein và peptide.

Unprecedented proteome coverage in 35 min gradient times
Phân tích tiêu hóa K562, gradient 35 phút (≈ 30 Mẫu mỗi ngày) dia-PASEF® của phân tích tiêu hóa K562. Quá trình xử lý dữ liệu được thực hiện bằng Bruker ProteoScape với TIMS DIA-NN.

 

Proteomics với thông lượng cao ở độ nhạy cao

prm-PASEF ® hưởng lợi từ TIMS như chiều phân tách thứ 4 cho tính chọn lọc chưa từng có, tập trung thời gian của các ion trong hộp TIMS để tăng độ nhạy và tốc độ cao do PASEF ® hỗ trợ để tăng số lượng mục tiêu tiền thân. Trong một lần thu thập, hàng trăm tiền chất có thể được nhắm mục tiêu mà không ảnh hưởng đến tính chọn lọc độc đáo và độ nhạy cao của thiết bị timsTOF Pro 2.

Kết hợp độ nhạy, tốc độ và độ chọn lọc, phương pháp thu nhận prm-PASEF mang lại độ lặp lại cao và định lượng chính xác cho số lượng lớn mục tiêu hoặc cho ứng dụng với gradient sắc ký ngắn (tức là <5 phút).

 

Targeted protoemics analysis in a colorectal cancer plasma study
Phân tích protoemias được nhắm mục tiêu trong một nghiên cứu huyết tương ung thư đại trực tràng. 1565 tiền chất (Nặng/Nhẹ) từ 565 protein đã được nhắm mục tiêu trong một thử nghiệm prm-PASEF®, sử dụng bộ PQ500 của Biognosys.

Mở rộng tầm nhìn với 4D-Metabolomics

Các chất chuyển hóa không nhắm mục tiêu được hưởng lợi từ mức độ bao phủ MS/MS cao như một thành phần chính của chú thích phức hợp. Các phương pháp Chuyển hóa 4D được tối ưu hóa của chúng tôi cung cấp cả dữ liệu định hình MS định lượng và phổ phân mảnh MS/MS trong cùng một phân tích mẫu, đạt được phạm vi bao phủ tính năng đa số ngay cả ở nồng độ chất phân tích thấp. PASEF ® cung cấp lựa chọn di động trước khi phân mảnh dẫn đến phổ phân mảnh rõ ràng và rõ ràng.

PASEF ® có thể di động chọn và phân mảnh từng hợp chất riêng biệt, dẫn đến quang phổ mảnh sạch. Việc loại bỏ các đoạn MS/MS có nguồn gốc từ ma trận cung cấp kết hợp thư viện tốt hơn cho Proadifen trong MetaboScape ® và do đó độ tin cậy cao hơn trong kết quả.

PASEF improves MS/MS spectra for better library matching results
PASEF® cải thiện quang phổ MS/MS cho ra kết quả tốt hơn.

Độ tin cậy cao hơn với 4D-Lipidomics

Tương tự như các mẫu proteomics, chiết xuất lipid có độ phức tạp mẫu cao do sự đa dạng về cấu trúc của lipid. Phổ MS/MS chất lượng cao là không thể thiếu để có được các chú thích lipid tự tin. PASEF ® mở khóa các quy trình công việc hỗ trợ CCS có thể được sử dụng để tăng thêm độ tin cậy cho chú thích lipid.

Dữ liệu lipididomics thu được trên timsTOF Pro 2 có thể được phân tích dễ dàng bằng MetaboScape ® , có công cụ chú thích không có thư viện sử dụng các quy tắc phân mảnh đã xuất bản và công cụ dự đoán CCS mới. Tận dụng tối đa cả 4 thứ nguyên có được.

PASEF ® có thể phân mảnh nhiều hơn gấp 10 lần tiền chất bằng cách sử dụng phân tách di động. Điều này loại bỏ các chất gây ô nhiễm chồng chéo và giải quyết các chất béo đẳng áp cũng như đồng phân. Phổ MS/MS thu được hiển thị các đoạn duy nhất cho từng lớp lipid dẫn đến các chú thích với độ tin cậy tăng lên.

Mobility Offset Mass Aligned (MOMA) data of isobaric lipids
Dữ liệu bù di động được sắp xếp theo khối lượng (MOMA) của lipid đẳng áp (A) Sơ đồ nhiệt cho thấy sự phân tách di động của hai phospholipid đẳng áp đồng rửa giải từ LC pha đảo ngược. (B) Phổ PASEF® MS/MS sạch sau khi tách độ linh động. (C) Các chú thích lipid độc đáo từ NIST SRM 1950 (chế độ ESI + ve) cho thời gian chạy độ dốc khác nhau.

Sàng lọc và định lượng thông lượng cực cao trong các mô matrix phức tạp

Tốc độ vượt trội của hệ thống timsTOF Pro 2 cho phép sàng lọc toàn bộ ẩn số bằng thu thập dữ liệu GC-APCI hoặc UHPLC VIP-HESI. Kết hợp với phần mềm TASQ ® , Bruker cung cấp giải pháp hoàn chỉnh từ thu thập dữ liệu đến phân tích dữ liệu tự động.

Áp dụng lọc di động cho sắc ký ion chiết xuất làm tăng độ nhạy trong các chất nền phức tạp bằng cách loại bỏ nhiễu. Có thể thấy rõ điều này trong dấu vết của Thiacloprid trong hành tây ở nồng độ 1 ng/mL. Các dấu vết thấp hơn đã được lọc ở phạm vi di động hẹp dần, cho phép khớp hoàn hảo với cơ sở dữ liệu TargetScreener, như được biểu thị bằng màu xanh lục của điểm số MRSQ

Độ bền cực cao

Yêu cầu làm sạch tối thiểu

Nhiều thiết bị MS được sử dụng cho các ứng dụng omics yêu cầu làm sạch hàng tháng khi chạy 24 giờ một ngày trên các nhóm mẫu lớn. Suy giảm hiệu suất ngay cả trong khoảng thời gian ngắn hơn. Độ bền vượt trội của timsTOF Pro 2 có nghĩa là thiết bị có thể chạy 24/7 trong nhiều tuần mà không làm giảm đáng kể độ nhạy hoặc các chỉ số hiệu suất khác.

Sản phẩm tương tự

Khối phổ MALDI-TOF

microflex ® LRF

Khối phổ MALDI-TOF

autoflex ® max

Khối phổ timsTOF

timsTOF MALDI PharmaPulse®

Khối phổ timsTOF

timTOF HT

Khối phổ timsTOF

timsTOF fleX MALDI-2

Khối phổ timsTOF

timsTOF fleX

Khối phổ MALDI-TOF

rapifleX ®

Khối phổ MALDI-TOF

MALDI Consumables