Phân tích biểu hiện gen với thể tích phản ứng thấp tới 250 nL

biểu hiện gen

Máy trạm của phòng thí nghiệm Access mang đến những khả năng mới thú vị để thực hiện xét nghiệm và sàng lọc phân tích biểu hiện gen hiệu suất cao bằng cách sử dụng qPCR. Máy trạm Access kết hợp Bộ xử lý chất lỏng Echo , Bộ ly giải tế bào sẵn sàng của Roche RealTime và hệ thống Roche LightCycler 480 thành một hệ thống tự động duy nhất để xét nghiệm biểu hiện gen với thể tích phản ứng thấp tới 250 nL. Với phần mềm linh hoạt và thao tác chất lỏng bằng sóng âm chất lượng cao, máy trạm Access là một nền tảng lý tưởng cho cả việc phát triển xét nghiệm và sàng lọc mà không gây ô nhiễm chéo.

  • Tăng công suất với các xét nghiệm 384– và 1536–giếng ở thể tích phản ứng thấp tới 250 nL
  • Làm việc trực tiếp từ các tế bào với việc bổ sung ly giải thể tích thấp và chuyển dịch lysate
  • Giảm chi phí ngay lập tức nhờ tự động hóa và thu nhỏ trong một nền tảng duy nhất
  • Không có ô nhiễm chéo khi truyền sóng âm

Đơn giản hóa thử nghiệm

Ứng dụng Echo Plate Reformat (EPR) cung cấp giao diện đồ họa để lập bản đồ chuyển cDNA cùng với hỗn hợp chính, đầu dò và mồi ở các thể tích khác nhau để dễ dàng thiết kế các xét nghiệm nhằm tối ưu hóa. Phần mềm điều khiển tự động hóa của máy trạm Access ngay lập tức chuyển đổi các giao thức truyền EPR thành các quy trình tự động với việc xác minh mã vạch, niêm phong, ly tâm, v.v.

Dữ liệu được thu thập từ việc tối ưu hóa xét nghiệm cho bộ xử lý chất lỏng Echo cho thấy khả năng giảm đáng kể thể tích ở cả hai đĩa xét nghiệm 384– và 1536– giếng.

Thử nghiệm với thể tích thấp 384-giếng

Hình 1. Phân tích biểu hiện gen nhanh chóng trực tiếp từ tế bào, ở thể tích thấp tới 250 nL

Quy trình làm việc tự động cho biểu hiện gen

Truy cập máy trạm với Echo Liquid Handler
Truy cập máy trạm với Bộ xử lý chất lỏng Echo

Gieo hạt tế bào

  • Hạt giống và tế bào nuôi cấy trong đĩa nuôi cấy mô giếng 384– hoặc 1536– được xử lý bằng Echo đủ tiêu chuẩn

Bổ sung đệm ly giải tế bào

  • Thêm bộ đệm ly giải một bước với Echo Liquid Handler
  • Chia tỷ lệ liền mạch từ đĩa 384– đến 1536–giếng

Thiết lập qPCR

Niêm phong & đĩa ly tâm

  • Niêm phong các đĩa PCR bằng seal trong suốt và cho máy ly tâm

Phân tích qPCR

  • Hiện đã có sẵn cho LightCycler 480
  • Có khả năng loại bỏ khi chạy qua đêm

Tùy chọn tích hợp

Xử lý chất lỏng Xử lý đĩa Bảo quản đĩa
All Echo Liquid Handlers:
Echo 550, Echo 555
PlateLoc Thermal Seale 20–Plate Random Access Racks
All Echo Software Applications:
Cherry Pick, Reformat, Dose–Response
Vspin Centrifuge 50–Plate Sequential Stacks
LXp Bulk Dispenser Keyence Barcode Reader
GX Nano Dispenser Vacuum Delidder
Multidrop Combi nL Bulk Dispenser Teleshake Shaker
XPeel Peeler

Việc tiết kiệm chi phí là rất cần thiết trong thử nghiệm này. Việc chuyển các xét nghiệm qPCR sang các định dạng mật độ cao có thể mang lại sự gia tăng đáng kể về thông lượng thử nghiệm.

Ngoài ra, bằng cách giảm lượng mRNA nguồn được tiêu thụ, các nhà nghiên cứu có thể tăng đáng kể số lượng thí nghiệm được thực hiện với số lượng mẫu ban đầu hạn chế. Khi thể tích thường dùng là 25 µL giảm xuống còn 250 nL bằng cách sử dụng Bộ xử lý chất lỏng Echo , mức tiết kiệm hỗn hợp gốc, đầu dò và mồi là hơn 95%. Chi phí tương tự có thể mang lại số lượng xét nghiệm chất lượng cao gấp 20 lần hoặc giúp tiết kiệm hàng chục đến hàng trăm nghìn đô la mỗi năm.

Nguồn: https://www.mybeckman.vn/resources/reading-material/application-notes/miniaturized-gene-expression-in-as-little-as-250-nl

Minh Khang là nhà nhập khẩu và phân phối trực tiếp thiết bị xử lý chất lỏng hãng Beckman Coulter.